Osoonil ja selle sekundaarsetel saadustel (näiteks hüdroksüül) on kõige tugevam bakteritsiidne ja virutsiidne toime, see võib olla kasulik nakkushaiguste leviku tõkestamiseks,
Katsed näitavad, et osooni sama kontsentratsioon tapab baktereid ja viirused on 600–3000 korda suuremas koguses kloori.
Kui osooni kontsentratsioon on 1 mg / l, võtab fekaalsete coli inaktiveerimine ainult 5 sekundit, sama efekti saavutamiseks vajalike kloori samade kontsentratsioonidega vajate 15 000 sekundit.
Osoon on rahvusvaheliselt tunnustatud keskkonnasõbralik roheline fungitsiid, mis ei põhjusta sekundaarset keskkonnareostust, kloor reageerib vees oleva orgaanilise ainega mitmesuguste klooritud orgaaniliste ühendite moodustamiseks nagu kloroform ja triklorometaan, need ained on tunnustatud vähki põhjustavateks mutageenideks. Kui inimesed ujuvad, imendub need mürgised ained kehasse (vees olev keha võib tunnis imada 500 ml vett).
Klooritud orgaanilised ühendid vees stimuleerivad ka silmi ja nahka, põhjustades punasilmsust ja nahalööbeid.
